Projet RENEW : Décrypter la logique du réseau génique contrôlant la régénération extrême
Dans le projet RENEW, nous déterminons les réseaux de régulation géniques (GRN) déclenchés par une blessure et qui contrôlent la régénération du corps entier en disséquant la dynamique transcriptionnelle et l'accessibilité de la chromatine à l'échelle du génome aux niveaux des tissus et des cellules.
Nous inférerons également et validons les trajectoires cellulaires et les éléments régulateurs à l'aide d'approches génétiques. Cette étude est basée sur les données obtenues dans le laboratoire au cours des cinq dernières années et est menée sur le nouveau modèle de régénération du corps entier - l'anémone de mer Nematostella vectensis (Cnidaria, Anthozoa) - développé et maîtrisé par le laboratoire.
Après une blessure, la capacité de régénération varie considérablement des mammifères, à régénération limitée, aux organismes aquatiques, ayant la capacité de régénérer leur corps entier, tels que les cnidaires.
Il est donc nécessaire de déterminer les réseaux de régulation des gènes sous-jacents à la régénération du corps entier afin de révéler les similitudes et en particulier les différences avec les mammifères. Pourtant, les GRN de régénération, en particulier d'invertébrés marins, ayant des capacités de régénération du corps entier tels que les cnidaires, sont à leurs balbutiements.
Jusqu'à présent, établir les GRNs contrôlant la régénération du corps entier chez les cnidaires, en particulier au niveau des cellules uniques, a été entravé par le manque de modèles appropriés et de techniques suffisamment sensibles. Nous sommes convaincues que cela est désormais possible en utilisant les approches de pointe scRNAseq et (sc)ATACseq maîtrisées par le consortium en combinaison avec Nematostella, un modèle cnidaire de régénération du corps entier que nous maîtrisons au laboratoire et qui convient pour disséquer génétiquement la fonction des gènes.
Afin de déterminer les GRNs sous-jacents à la régénération du corps entier chez Nematostella, nous avons trois objectifs spécifiques :
1. Déterminer la dynamique transcriptionnelle et les éléments régulateurs actifs aux niveaux tissulaire et unicellulaire en utilisant les approches scRNA-seq et ATAC-seq.
2. Déduire la dynamique cellulaire, les interactions géniques des GRNs de régénération ainsi que les facteurs qui les contrôlent en utilisant une reconstruction de trajectoire cellulaire et une analyse d'enrichissement de motif.
3. Valider expérimentalement les éléments centraux et les interactions géniques des GRNs de régénération en testant les éléments activateurs spécifiques à la régénération et en utilisant des approches fonctionnelles gène-spécifiques à l'aide de la technologie CRISPR / Cas9.
Ces objectifs nous permettront de révéler la dynamique cellulaire précise, tels que les trajectoires des cellules souches en réponse à la blessure, ainsi que les mécanismes de régulation sous-jacents impliqués dans l'activation des modules centraux spécifiques à la régénération. Ceci est crucial lors des études sur l’évolution / comparatives afin de mieux comprendre pourquoi certains animaux régénèrent alors que d'autres ne le font pas (ou en font de manière limitée). De plus, cette étude intégrative est essentielle pour développer des approches biomédicales permettant l’initiation de programmes régénératifs dans les organes ou les tissus ayant perdu cette capacité au cours de l'évolution ou au cours du vieillissement.
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Découvrez le portrait d'Éric Röttinger à l'origine du projet RENEW !
Fête de la Science 2024 : Océan de savoir !
Le Festival des sciences de Nice a eu lieu au jardin Albert 1er le week-end du 12 et 13 octobre 2024 pour le grand public et le vendredi 11 octobre pour les scolaires. Pour sa 6ème édition, le Festival des sciences s'est déroulé sur la thématique « Océan de savoir ».
A cette occasion, les chercheurs de la Côte d’Azur, les associations de médiation scientifique, les musées, les services de la Métropole et de la Ville et les entreprises sont allés à la rencontre des scolaires et du grand public au cœur de la ville de Nice pour parler de la recherche et de l’innovation.
SAMEDI 12 OCTOBRE 2024
14H30 - 15H15 - CONFÉRENCE - LES SECRETS DE LA RÉGÉNÉRATION - PROJET ANR RENEW : DÉCRYPTER LA LOGIQUE DU RÉSEAU GÉNIQUE CONTRÔLANT LA RÉGÉNÉRATION EXTRÊME
Par Eric ROTTINGER, chercheur à l’IRCAN - Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (Université Côte d’Azur, CNRS, Inserm)
18H – SPECTACLE « LES ÉMOTIONS DE LA RECHERCHE »
Par L’orchestre d’harmonie Casa’rmonie jouera un répertoire « Expéditions » entrecoupé d’interventions de chercheuses et chercheurs dont Éric Rottinger qui partageront avec le public émotions et expériences personnelles de leur recherche sur le milieu marin.